马尾区位于东经119°37′，北纬25°29′，地处福州市东南部，闽江下游北岸，距闽江口17海里。东濒闽江，西与晋安区接壤，南与仓山区、长乐区隔江相望，东北毗邻连江县，地势西北高东南低。土地面积26435.48公顷，海域面积约44平方千米。

在土地资源方面，2021年马尾区面积26435.48公顷，其中湿地2061.9公顷，耕地939.5公顷，种植园用地806.3公顷，林地14771.73公顷，草地221.62公顷，城镇村及工矿用地3654.76公顷，交通运输用地1011.59公顷，水域及水利设施用地2547.58公顷，其他土地420.5公顷。

矿产资源方面，2021年发现矿产资源8种。金属矿有钍矿、钍铌矿、铌钍矿、铁锰矿4种4处，为矿化点，远景差。非金属矿有高岭土矿、河砂矿、矿泉水、花岗岩石材矿4种10处。其中河砂矿位于禁采线范围内，属禁止开采矿种；高岭土矿规模小，不具远景；唯一可使用的建筑用石料资源丰富，但受限制影响，工作程度不高。年内全区没有批准开采的矿山。

森林资源方面，2021年林业用地面积14953.17公顷，其中生态公益林面积11705.48公顷，商品林面积3247.69公顷。天然林4609.01公顷。有林地面积13299.24公顷，森林蓄积量84.44万立方米，森林覆盖率47.18%。植被属南亚热带雨林小区，经鉴定有126科304属430种，其中香樟、建柏、金毛狗等为国家二级保护树种。

湿地资源方面，福建马尾闽江河口湿地省级自然保护区总面积869公顷，其中缓冲区面积447公顷，实验区面积422公顷。湿地各类型面积包括河口水域400.6公顷，潮间带泥滩467公顷，岛屿1.4公顷。主要保护对象为滨海湿地生态系统和水鸟资源，植物资源主要分布在白猴屿岛上。

海洋资源方面，海域面积约44平方千米，海岸线58千米，海岛8个，其中居民海岛1个。海域底栖生物近170种，浮游植物有六大类65种，浮游动物有五大门类。海产鱼类及其他海生动物多产于琅岐东南部闽江口，海水养殖主要品种有鲈鱼、南美白对虾、锯缘青蟹、文蛤、缢蛏等，淡水养殖主要品种有草鱼、青鱼、鲢鱼、鳙鱼等。

水资源方面，区内闽江过境长度37千米，支流有磨溪、马鞍溪等14条溪流，河汊纵横形成网状水系，溪流总平均迳流量1.95亿立方米。地下水资源较贫乏，有松散堆积层孔隙水、风化层孔隙裂隙水、基岩裂隙水3种类型，除琅岐岛个别地区和山区地带外，其余水质良好。

马尾历史悠久，西周时属七闽地，秦时属闽中郡，西汉时属东冶，东汉光帝建武元年（公元25年）各地商船经过马尾来往福州，开始了水上贸易，人口渐繁。唐代至清末属闽县。明宪宗成化十年（1474年）市舶司从泉州移设福州，马尾港地位更为突出。1866年洋务派在马尾创办船政，1884年爆发中法海战。1982年设马尾区直属福州市，1984年设立经济技术开发区，1991年设立马尾科技园，1992年设立福州保税区。

近年来马尾区获得多项荣誉，包括2026年1月被认定为2025年国家学前教育普及普惠县和义务教育优质均衡发展县，2025年位列全国科技创新百强区第71名，2024年县域新型工业化综合实力全国500强第298位，2023年被命名为福建省“建筑之乡”，2022年GDP总量675.34亿元，并被命名为第六批国家生态文明建设示范区。2021年入选中国高质量发展百强区和中国生活品质百优县市。