独山镇的名称历经演变，最初名为“堵山”，后演变为“独山”。清中期曾在此设“独山镇”。清末宣统年间，巨野县令赴金山香火大会，触景生情，认为“有金山必有玉峰”，遂将“堵山”改为“玉山”，“独山镇”也随之更名为“玉山镇”。至民国年间，又恢复为“独山镇”并沿用至今。

独山镇位于巨野县城东南14公里处，辖60个行政村，总人口6.2万人。镇域总面积86.6平方公里，其中耕地面积10万亩。这里地势平坦，四季分明，雨水充沛，物产资源丰富。农业以小麦、玉米、大豆、花生和棉花为主，同时也是鲁西黄牛、青山羊、小尾寒羊的重要饲养繁育基地。

独山镇交通条件十分便利，东依津沪铁路，西邻京九铁路，北靠新石铁路，境内有327国道、聊商公路、巨金公路等多条交通干线纵横交错。凭借便捷的区位优势，游客可一日往返游览曹州牡丹、泰山、曲阜、水泊梁山等著名风景区。镇内的金山公园是重要的风景旅游点。目前，独山镇已实现村村通电、通电话、通有线电视、通柏油公路，基础设施日趋完善。

在教育、科技、文化、卫生等各项事业稳步发展的同时，独山镇也获得了多项荣誉。2023年8月，独山镇（香辛类蔬菜）入选农业农村部、财政部发布的首批国家农业产业强镇名单。此外，2022年、2021年、2020年独山镇多次上榜“淘宝镇”名单，2020年还入选山东省农业产业强镇，2019年入选全国农业产业强镇建设名单。

独山镇拥有丰富的历史文化遗存。邢海刘氏家祠建于清代，金山崖墓和红土山汉墓均为西汉时期遗存，这三处文物点均在2015年被公布为山东省第五批省级文物保护单位。在历史沿革上，独山春秋时为鲁国西境，西汉属巨野县，1694年设独山屯，1958年建立人民公社，后经撤社建乡、撤乡设镇，并于2001年将双庙乡并入，形成了今天的行政格局。