别口镇因镇政府驻别口沱而得名。别口镇位于重庆市潼南县城以东，地处涪江河潼南段最下游，东南与合川市太和镇、铜梁高楼镇接壤，西连潼南龙项乡，北邻潼南上和镇。清朝时期，别口镇属合川县。清雍正六年（1728年）建场于老场坝，清嘉庆元年（1796年）迁至别口沱，建白盐乡后称别盐乡。民国元年（1912年）后，又改为佛盐乡，后因驻地别口沱而改名别口乡。1954年1月，别口乡从合川县划入潼南县，属太和区。1958年6月，别口乡改设别口公社。1983年12月，撤别口公社改为别口乡。2011年4月，别口乡改为别口镇。

改革开放以来，别口经济社会取得了长足发展。2002年，全乡农业总产值达到2400万元，年增长速度达到10%，粮食总产达到5278吨，人均占有粮食439公斤，农民人均纯收入达到1798元，农民存款储蓄余额达到1469万元。非公有制经济总产值达到1884万元，创利税82万元。私营企业总数达到13个，个体工商户总数达到43个。固定资产50万元以上的企业2个，年上缴利税10万元以上的企业1个。别口镇辖5个行政村37个村民小组，幅员面积30.48平方公里，总人口12333人，其中非农业人口404人。乡直单位包括中心小学、信用社、卫生院、粮店、兽防站、派出所；内设机构有党政办、经发办、社会事务办、民政办、农业综合服务中心、财税所、人口与计生办、计生服务站、村建国土所、文体站。

别口是潼南重要的特色农产品生产基地之一，享有茶叶之乡、板栗之乡、蚕桑之乡的美誉。从70年代至今，别口已有30余年的种茶历史。成片茶林主要分布于金仙村和飞凤村，面积达到600余亩，年产绿茶10余吨，远销北京等地，市场供不应求。板栗栽植面积达到1000余亩，主要分布于金仙村、高岩村，年产板栗约17吨，是潼南最大的板栗生产基地。桑树栽植面积达到3000多亩，可养蚕4000余张，产茧约65吨。美国纯白豌豆种植面积近1000亩，成为重庆市白豌豆种子生产基地。别口镇科郎寺有一塔，俗称白塔，高7层30米，矗立于青山绿水之间，距今已有400多年的历史，是县级重点保护文物。